農產品檢測實驗室可設置如下幾個部分：業務收樣室、樣品貯藏室、樣品處理室、試劑貯藏室、樣品檢測前處理室、儀器分析室、稱量室、烘干室、標準溶液配置室、感官分析室、品質分析室、微生物檢測室、成分檢測室、食品毒理分析室等。每個部分都有基本要求和特殊要求，業務收樣室主要與客戶打交道，接收樣品和發送檢測報告，處理客戶抱怨，是實驗室工作的窗口，應設置在建筑物的一層靠近門廳的位置或者每層建筑中廳的位置，總之，一切以方便客戶為準則。
農產品檢驗實驗室建設是一個復雜的系統工程，結合當前農產品實驗室建設過程中的問題，簡單地介紹一下在農產品檢測實驗室建設過程中需要注意的事項。
應遵循的原則，建設農產品檢驗實驗室的目的就是檢測農產品的質量，為生產者、消費者及提供科學、準確的質量數據。實驗室內產品檢測，會用到大量有毒有害試劑，對實驗室人員、實驗室儀器甚至周邊環境容易造成不利影響。
1、保護實驗室人員、實驗室設備和周邊環境，是農產品檢測實驗室須注意的重要原則之一。
2、在農產品檢測實驗室中對資源的合理利用，節約能源，也是需要注意遵守的原則。
3、實驗室人員的性，實驗室設備的齊全性和精密程度，都是確保檢測結果準確性不可或缺的部分。
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